Die Neustädter Kirche war immer auch Universitätskirche. Schon immer wohnten Universität und Kirchengemeinde unter einem Dach. So verdankt die Kirche den Einbau ihrer Emporen dem guten Besuch der Gottesdienste im 18.Jahrhundert. Im Jahr 1913 installierte der bayerische König das Amt eines Universitätspredigers. Er war zuständig für die Seelsorge an Universitätsangehörigen und für Gottesdienste. Geblieben sind aus dieser Tradition die Universitätsgottesdienste, Auftritte der Universität und eine gute Verbindung zur ESG (Studierendengemeinde).
Universitätskirche, das heißt: Kirche und Wissenschaft treffen sich unter einem Dach. Universitätsangehörige und Gemeindemitglieder haben einen gemeinsamen Ort. Diesen Treffpunkt versteht die Kirchengemeinde als eine Chance, pflegt ihn und arbeitet gerne mit der Universität zusammen.